执法人力、物力有限，是造成鱼药市场混乱的另一个重要原因。北海市农业局畜牧科只有３个人，下面每个区对应的执法人员只有１个，这几个人担负全市兽药生产、销售监管和畜牧技术引进、推广等８项职能，不说执法财力、精力，仅从如此少的人力看，也很难监管庞大的市场。由于没有检验设备，对一些涉嫌禁用药物、假药只能拿到南宁去化验。科长何德栋建议，在地市一级执法部门建立兽药、饲料监督监测机构。
福州市工商局商检所副所长蔡仙春说，现在水产品问题很多，药物残留、福尔马林浸泡等问题比较严重。福州市已从今年初就在全国率先配备了一台流动检测车，对全市各个集贸市场进行监管。但是限于条件，水产品也只能进行福尔马林的定性检测，对氯霉素、呋喃唑酮等违禁药残留还不能检测。
由于行政监管主体的分割和畜牧兽医部门人员有限，鱼药市场管理往往采取多部门联合执法的形式。这种行为一年能进行一两次。而日常执法几乎是一片空白，一些不法经营分子在联合执法检查过后，很快光明正大地卷土重来。不少执法人员认为，这种运动式的联合执法实质是形式主义行为，根本起不到净化市场的作用。
许多市民建议，国家用应加重对违法生产、经营鱼药行为的打击力度。在福州市鼓屏路市场，市民林小芬对记者说：“氯霉素可诱发白血病，呋喃唑酮可引起致癌，这些药物怎么能给水产品喂食？政府应加大打击力度，罚就罚他个倾家荡产，让这些不法分子再也不敢赚这些没良心的钱。”因为怕养殖的鱼有氯霉素、呋喃唑酮等违禁药残留，她现在一般只买一些野生的鱼类，或者买几条活鱼放在家里养几天再吃。
一些专家表示，政府部门自身也要加强依法行政行为。如严格审批制度，撤销鱼药生产过多过滥的地方标准和批号，提高生产环节的准入门槛。